Das 1989 eröffnete und 2008 umgebaute Museum präsentiert die Ausstellungen "Das Reiterlager von Carnuntum" und "Die antike Wasserwelt von Carnuntum". Im Keller des Museums befindet sich eine echte Rarität: das Kreuzungsbauwerk. Ein Hauptabwasserkanal, der entgegen jeder antiken Bauordnung eine Trinkwasserleitung des Reiterlagers kreuzt. Im Garten ist außerdem ein Lapidarium mit zwölf Grabsteinen von einem Gräberfeld rund um das Auxiliarkastell zu besichtigen. In Stein gemeiselte Lebensläufe einstiger Bewohner geben persönliche Einblicke in deren Privatleben.
